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全基因組測序揭示肝癌相關(guān)基因突變

來源:中國醫(yī)藥報(bào) 時(shí)間:2013-07-09 10:40:50 熱度:994

  本報(bào)廣東訊  由亞洲癌癥研究組織(ACRG)、深圳華大基因研究院等多家單位合作,用全基因組測序技術(shù)鑒定出一系列與肝細(xì)胞癌(HCC)相關(guān)的基因和通路,為肝癌的分子診斷、治療及靶向藥物開發(fā)等奠定了重要的遺傳學(xué)基礎(chǔ),研究成果6月20日在《基因組研究》(《Genome Research》)雜志上發(fā)表。這是繼2012年3月份在《自然-遺傳學(xué)》上發(fā)表的乙肝病毒(HBV)整合機(jī)制研究之后,該研究團(tuán)隊(duì)在肝癌研究中所取得的又一重大突破。
  肝細(xì)胞癌是目前最常見的一種肝癌,約占原發(fā)性肝癌的90%,我國更是該病的高發(fā)區(qū)之一。癌變從本質(zhì)上講,是體細(xì)胞隨機(jī)積累起來的一些關(guān)鍵性基因組、轉(zhuǎn)錄組以及表觀遺傳變異所造成的。盡管當(dāng)前已有眾多肝細(xì)胞癌相關(guān)的研究,但由于技術(shù)和樣本量的限制,依然沒有發(fā)現(xiàn)明確具有普遍意義的基因突變。新一代測序技術(shù)從全基因組水平上為肝細(xì)胞癌的研究提供了一條新途徑,能夠使科研人員更好地認(rèn)識腫瘤生物學(xué),從而為新藥研究及開發(fā)等奠定堅(jiān)實(shí)的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。
  在研究中,科研人員分別對88例肝細(xì)胞癌患者(其中81例HBV陽性和7例HBV陰性)的腫瘤組織和癌旁組織進(jìn)行了全基因組測序。通過對全基因組范圍內(nèi)的單堿基變異(SNV)、拷貝數(shù)變異(CNV)、插入缺失(Indel)、結(jié)構(gòu)變異(SV)以及HBV整合位點(diǎn)進(jìn)行檢測,發(fā)現(xiàn)了一系列與HBV介導(dǎo)的肝細(xì)胞癌發(fā)生、發(fā)展相關(guān)的基因突變及相關(guān)信號通路變化:WNT/β-catenin和JAK/STAT信號通路是肝細(xì)胞癌發(fā)生過程中的兩條關(guān)鍵性通路。在其他類型癌癥中,普遍存在的是EGFR、PI3K和MAPK信號通路的變化,而在肝細(xì)胞癌中所發(fā)現(xiàn)的WNT/β-catenin和JAK/STAT這兩條不同于其他的信號通路,可能是一些靶向治療方法在其他癌癥中能夠發(fā)揮作用,而在肝細(xì)胞癌中無法奏效的原因所在。這為日后的肝細(xì)胞癌靶向藥物的開發(fā)奠定了分子基礎(chǔ)。
  此外,研究鑒定出一系列與肝細(xì)胞癌發(fā)生相關(guān)的基因,其中β-catenin基因是最易發(fā)生突變的致癌基因,TP53基因是最易發(fā)生突變的抑癌基因。該研究還發(fā)現(xiàn)了一些普遍存在的活化驅(qū)動突變。比如,JAK1基因活化突變,可導(dǎo)致下游一系列信號的激活,從而引發(fā)肝細(xì)胞癌。該活化基因的發(fā)現(xiàn),為肝細(xì)胞癌的治療提供了一條途徑,即現(xiàn)在多用于白血病和風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎的治療藥物Tasocitinib和Ruxolitinib等JAK1酶抑制劑在肝細(xì)胞癌的臨床治療中具有潛在價(jià)值。
  華大基因該項(xiàng)目負(fù)責(zé)人鄭漢城表示:“肝癌在目前所有的癌癥治療中最為棘手。這項(xiàng)研究用全基因組測序鑒定出一系列肝細(xì)胞癌相關(guān)的基因和通路,有助于更好地理解腫瘤發(fā)生的分子機(jī)制,并為日后肝癌的分子診斷、治療提供了新思路?!保▌⑩[  張佳)

(責(zé)任編輯:秋彤)

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