來源:中國醫(yī)藥報 時間:2013-01-16 14:58:41 熱度:944
本報訊 為了建立抗癌藥物活性的計算生物學(xué)預(yù)測系統(tǒng),中國科學(xué)院昆明動物研究所生物信息與系統(tǒng)生物學(xué)實驗室黃京飛研究員指導(dǎo)李功華博士開發(fā)了一個新的基于分子藥效團(tuán)的小分子比對算法,并將該算法應(yīng)用于預(yù)測小分子的抗癌活性。該研究發(fā)表在最新一期的計算生物學(xué)雜志《Bioinformatics》上。
癌癥是目前世界人口死亡的第一原因,開發(fā)新的抗癌藥物是醫(yī)藥學(xué)界的熱點和難點。但直接采用實驗的方法篩選抗癌藥物花費(fèi)大、時間長。以小分子為例,現(xiàn)在已知的小分子化合物超過了1000萬個,直接采用實驗的方法從這1000萬個化合物中篩選藥物小分子幾乎是不可能的。因此,建立一個高效、可靠、準(zhǔn)確的抗癌藥物的計算生物學(xué)篩選系統(tǒng),對發(fā)掘新的抗癌藥物具有重要意義。
通過交叉驗證,李功華得到的結(jié)果令人振奮:其預(yù)測的線下面積(AUC)達(dá)到了0.878,顯示該算法能很好地預(yù)測藥物小分子的抗癌活性。為了使該算法能被不同學(xué)科的研究者和醫(yī)藥工作者應(yīng)用,李功華還開發(fā)了一個簡便易用的預(yù)測抗癌藥物活性的網(wǎng)頁服務(wù)器(http://bsb.kiz.ac.cn/CDRUG/)。(白毅)
(責(zé)任編輯:秋彤)
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