來源:科技日報 時間:2021-08-02 23:02:46 熱度:754
科技日報記者 李宏策
從公然把新冠病毒稱為“武漢病毒”,到悍然退出世衛(wèi)組織,美國一直都試圖把疫情政治化、病毒污名化、溯源工具化,甚至全然無視科學(xué)和事實(shí),炒作有罪推定的“實(shí)驗(yàn)室泄漏論”,肆意鼓吹針對中國開展新一輪溯源調(diào)查,嚴(yán)重干擾國際溯源研究合作。
圖源:美國CDC
美國及一些西方媒體不擇手段散播“政治病毒”,企圖誤導(dǎo)公眾,破壞科學(xué)溯源工作,引起科學(xué)界公憤。對此,歐洲精準(zhǔn)醫(yī)療平臺首席科學(xué)家、巴斯德研究所免疫學(xué)博士鞠麗雅在接受科技日報采訪時指出,溯源工作必須尊重客觀事實(shí),尊重科學(xué)數(shù)據(jù),摒除政治偏見。
全球標(biāo)桿竟被扣上源頭罪名
鞠麗雅博士表示,武漢病毒研究所于2020年1月12日向聯(lián)合國世界衛(wèi)生組織提交了新冠病毒全基因組序列。由于提交的測序結(jié)果質(zhì)量高、描述清晰,該基因序列被“全球共享流感數(shù)據(jù)倡議組織”(GISAID)等多個數(shù)據(jù)庫用來作為重要的“參照序列”。
鞠麗雅介紹,根據(jù)GISAID數(shù)據(jù)庫的描述,“參照序列”是用于和此后繼續(xù)錄入的新冠病毒基因序列做對照比較,用以觀察全球各地新冠病毒的基因特點(diǎn)。
之所以能夠作為“參照序列”,這得益于中國科學(xué)家利用長期以來積累的平臺、技術(shù)和人才優(yōu)勢,迅速確定新型冠狀病毒,并快速和高質(zhì)量地完成病毒毒株分離和全基因組序列測定。第一時間向全球分享病毒基因序列,不僅成為全球新冠病毒數(shù)據(jù)庫的起始“標(biāo)桿”,更為各國開展抗病毒藥物篩選、病毒檢測和疫苗研究提供了基礎(chǔ),也為全球抗擊疫情贏得了時間。
但這樣的成果卻被一些媒體利用,將其作為新冠病毒起源于武漢的所謂證據(jù)。如在法國《電報》題為“為什么布列塔尼變異株是20C”的報道中,作者以科普的形式介紹新冠病毒的分類與變異株命名方法,并“專業(yè)”地引用GISAID數(shù)據(jù)庫的新冠病毒序列比較分枝圖。
但該報道對該科學(xué)圖表作出的解釋是,“武漢發(fā)現(xiàn)的19A和19B是新冠疫情初期的主要病株。從19A派生出的20A于2020年3月占領(lǐng)歐洲,繼而分布全球。20B和20C是從20A派生出的龐大分枝”。為了表明其專業(yè)性,報道還引用一張?jiān)从诟櫲蛐鹿谧儺愔昃W(wǎng)站Nextstrain的簡化示意圖,并解釋說,“Nextstrain根據(jù)GISAID數(shù)據(jù)庫的病毒序列所做的新冠病毒基因特點(diǎn)可視化的工具”。
Nextstrain新冠病毒分類簡化示意圖
對于廣大讀者而言,看到這里都會認(rèn)為全球流行的新冠病毒都是從武漢發(fā)現(xiàn)的19A病毒株變異來的,該報道也就”成功“地將病毒源頭鎖定在武漢。但實(shí)際情況并非如此。
鞠麗雅博士介紹,GISAID數(shù)據(jù)庫于2016年建立,用于監(jiān)測禽流感病毒序列,在新冠疫情暴發(fā)后開始向全球征集新冠病毒序列,以便進(jìn)行相互之間的比較。通過其網(wǎng)站可以看到這樣的圖表(下圖),顯示從疫情初期至今收錄的全球新冠病毒序列和模擬的關(guān)系圖譜。
GISAID數(shù)據(jù)庫對于最初收錄的19A有專門說明 (下圖):“鑒于 Wuhan/Hu-1/2019 的高質(zhì)量測序結(jié)果,被GISAID用來作為正式參照序列”。
所謂的“參照序列”,用于“被參照序列”進(jìn)行比較,以鑒別不同新冠病毒的基因差異。具體來說,數(shù)據(jù)庫利用計算機(jī)軟件處理,主要是基于氨基酸相對突變率矩陣(常用PAM250)計算出不同序列間的差異性積分,而推演出可能的序列演化樹。在這里,有一個定義必須弄清楚,用序列間的差異靠計算機(jī)軟件做出來的“進(jìn)化樹”關(guān)系,只是一種理論性的演化推斷,而不是家系或傳代關(guān)系。所以GISAID數(shù)據(jù)庫的圖表不是親子或傳代關(guān)系。就好像白人與黑人做比較,二者都是人,計算機(jī)登記的差別在于膚色,但不是親子關(guān)系。
另一個權(quán)威的新冠病毒序列數(shù)據(jù)庫,NIH下屬的NCBI新冠病毒資源庫也同樣非常清楚的標(biāo)注,參照序列采用的是中國發(fā)表的NC_045512/HU-1序列。(下圖)
根據(jù)GISAID和NCBI的病毒基因庫數(shù)據(jù)還延伸出一系列的病毒分析軟件系統(tǒng),比如Next strain,PangoLineages,CovSpectrum,Mutation Situation Reports,CoVariants等。但無論軟件采用什么計算方法,參照序列的原則沒有變。“參照”序列不是“源頭”序列,這個是最起碼的科學(xué)常識。
鞠麗雅認(rèn)為,中國科學(xué)家最先發(fā)現(xiàn)、測序并向全球分享的新冠病毒基因序列是人類抗擊疫情的“首戰(zhàn)”,首戰(zhàn)告捷。中國發(fā)布首個序列讓抗擊新冠由盲目應(yīng)對進(jìn)入到可測定、可診斷、可跟蹤的新階段,該貢獻(xiàn)具有里程碑意義。而且迄今全球開發(fā)的新冠疫苗都離不開中國報告的基因序列。這一成果早已經(jīng)成為全球合作抗疫的“標(biāo)桿”。
但西方媒體不尊重客觀事實(shí),竟然將全球數(shù)據(jù)庫引用的參考標(biāo)桿作為源頭的證據(jù),不得不懷疑其專業(yè)性和用心。
鞠麗雅強(qiáng)調(diào),如果說因?yàn)槭紫劝l(fā)表了高質(zhì)量的病毒序列就被扣上新冠源頭的罪名,那么,最先發(fā)現(xiàn)艾滋病病毒的蒙塔涅教授就應(yīng)該是全球艾滋病的罪魁,而不是諾貝爾醫(yī)學(xué)獎獲得者;發(fā)現(xiàn)細(xì)菌的巴斯德先生,就應(yīng)該是全球致病細(xì)菌的負(fù)責(zé)人了。相比之下,武漢團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)該憑借新冠研究而獲得諾貝爾醫(yī)學(xué)獎,而不是被指責(zé)。
溯源需要全球提供基因數(shù)據(jù)
如果要鑒定病毒間的親子關(guān)系,首先要找到相同的遺傳性狀,因?yàn)樯矬w的遺傳是有連鎖性的,然后再根據(jù)其他的點(diǎn)突變來判斷傳代的情況。法國巴斯德研究所于2020年4月24日發(fā)表的《法國新冠病毒遺傳基因特點(diǎn)》用的就是家系研究方法(下圖)。
巴斯德研究所發(fā)表的這張圖很清晰地顯示,法國北方地區(qū)的新冠病毒都來自于同一個家族,都帶有C3037T_C14408&_A23403G的連鎖遺傳印記,再根據(jù)點(diǎn)突變的變化而分辨出2020年4月份流行的重癥患者的病毒已經(jīng)是第8代或者更老,也因此得出的判斷是,法國早在2020年初或者更早的時間就已經(jīng)有新冠病毒傳播,該結(jié)果也和此后法國不斷發(fā)現(xiàn)早期疑似新冠病毒感染者得很好地印證。
圖中還包括2020年1月24日和28日在巴黎收治的4位湖北患者,他們感染的病毒株和法國流行的病毒屬于完全不同而且很遙遠(yuǎn)的譜系,湖北感染者攜帶G22661T印記,而且非常年輕。
鞠麗雅介紹,巴斯德研究所的家系研究結(jié)果顯示,法國的新冠疫情源自本土的、可能在2020年之前就流行的新冠病毒毒株,其遺傳性狀與來自中國的輸入病例感染的病毒毒株相差甚遠(yuǎn)。
鞠麗雅指出,從新冠病毒流行的總體情況看,多個源頭、多點(diǎn)暴發(fā)已經(jīng)是明顯的客觀事實(shí),多國已經(jīng)陸續(xù)發(fā)現(xiàn)2019年本土出現(xiàn)的早期病例。
以法國為例,法國科學(xué)家的一項(xiàng)研究表明,一名男子早在2019年12月27日就已經(jīng)感染新冠病毒,其職業(yè)為魚販,在巴黎機(jī)場附近的一家零售商工作,經(jīng)常接觸來自海外的旅客,也接觸冷鏈運(yùn)輸。
另據(jù)法國國家衛(wèi)生醫(yī)學(xué)研究所等機(jī)構(gòu)聯(lián)合開展一項(xiàng)名為“SEROCO”的大規(guī)?;厮菅芯?,針對來自法國12個地區(qū)的9144份志愿者血清樣本進(jìn)行新冠檢測,并在2019年11月采集的樣本中檢測出痕量抗體。該研究估算,新冠病毒于2019年11月至12月在法國的感染率已達(dá)到千分之一量級。且這些病例并非聚集在某些地區(qū),而是零星散布在法國各地。
“SEROCO”回溯研究發(fā)現(xiàn)的感染者對2019年的病情進(jìn)行了回顧。其中一名感染者的血液采集時間為2019年11月29日,其室友于11月初由加拿大蒙特利爾返回法國,一周后該室友開始劇烈咳嗽,感染者本人也在采血前一周開始劇烈咳嗽。另一名女性感染者一度失去嗅覺和味覺,她曾于2019年11月前往西班牙,其家人于2019年10月至12月患不明肺炎。
法國北部萊茵河地區(qū)醫(yī)院對2500名肺部疾病患者的CT進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)2019年11月至12月已有多名患者有典型新冠肺炎影像。在圣誕節(jié)假期之后,法國于2020年3月6日起進(jìn)入暴發(fā)期。
除了法國,美國國立衛(wèi)生研究院研究發(fā)現(xiàn),美國5個州的新冠病毒感染證據(jù)在2019年12月就已出現(xiàn)。意大利米蘭市國家癌癥研究所 (INT) 和錫耶納大學(xué)的研究顯示,新冠病毒自 2019年9月起已在意大利傳播。
對此,法國國家衛(wèi)生醫(yī)學(xué)研究所法布里斯·卡拉特教授表示,他認(rèn)為所有的病毒并非都源自武漢。新冠病毒可能在此前已經(jīng)于全球范圍以無癥狀感染存在一段時間。應(yīng)該將這些比武漢更早患者的病毒基因序列公布,并進(jìn)行透明的比對分析。
鞠麗雅博士認(rèn)為,溯源必須基于確鑿的數(shù)據(jù),而不是基于政治偏見的有罪推定。若能在全球范圍開展新冠病毒家系研究將可能為溯源提供有力線索,這就需要各國提供最初病例的病毒基因數(shù)據(jù)。但遺憾的是,目前相關(guān)工作還沒有啟動。
鞠麗雅強(qiáng)調(diào),病毒溯源必須通過國際合作。新冠病毒是全人類的公敵,全世界的科學(xué)家和各界人士應(yīng)該同心攜手,為人類共同的命運(yùn)而努力奮爭。
(責(zé)任編輯:秋彤)
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