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人體全基因測序1天完成指日可待

來源:科技日報 時間:2014-05-27 05:30:44 熱度:835

本報記者  張 曄

    在人體的基因中,有30億個堿基對,每個人的不同,就是由堿基對排列差異造成的。要想測出它的全部序列,現(xiàn)在的技術(shù)最少需要兩三個星期、500萬美元。由東南大學擔綱的第三代人類基因測序關(guān)鍵技術(shù)研究取得重要進展,人體全基因測序有望只需1000美元、在1天時間內(nèi)完成。這是記者5月24日從在南京舉行的“第十一屆設(shè)計與制造前沿國際會議”上獲悉的。
    “人類基因組計劃在2003年完成人體全序列的基因測定,但第一代測序方法高昂的時間和經(jīng)濟成本均令人望而生畏?!苯K省微納生物醫(yī)療器械設(shè)計與制造重點實驗室副主任、東南大學機械工程學院副院長陳云飛介紹,第一代基因測序方法歷時12年、耗資數(shù)十億美元,近兩年迅猛發(fā)展的第二代測序儀讓人類基因組重測序的費用降低到10萬美元以下,測序時間也縮短到6個月。但是,這樣的價格和時間,對于個人用戶來說仍然太高,因而極大地限制了臨床應(yīng)用和基礎(chǔ)理論研究。
    2004年,美國國家人類基因組研究所啟動了“千元基因組測序研究項目”,目的是讓人類基因組測序費用降至1000美元以下。2006年,依托東大的江蘇省微納生物醫(yī)療器械設(shè)計與制造重點實驗室,開展了“基于微納制造的第三代基因測序系統(tǒng)”研究。
    “第一代、第二代基因測序使用的都是化學方法,我們采取的是物理方法,重點之一是研制能做納米孔的樣機?!标愒骑w舉了個例子,“DNA在人體細胞里,就像頭發(fā)絲一樣團成一團,如果能把它們拉直,就能清楚地看到基因序列是如何排列的?!?br />     關(guān)鍵問題是,怎么把DNA序列拉直?陳云飛說,科研人員想到一個辦法,那就是做一個非常小的孔,就像穿針眼一樣,讓基因從這個小孔里一一穿過。
    多小的孔才合適呢?陳云飛說,一根頭發(fā)絲的直徑有7萬納米,而這個小孔的直徑,目標是1納米。
    從2000年開始,課題組的科研人員經(jīng)過反復實驗,選擇了氮化硼和石墨烯作為原材料進行加工?!澳壳耙呀?jīng)做出2納米直徑的小孔了,可以開始測量短序列基因的測定?!标愒骑w說。
    科研人員將納米孔貼在一個膜上,將這個膜插入溶液中,隔開溶液池,通上電極之后,DNA在溶液里是帶負電的,它就會向正電極一側(cè)游,因為孔很小,堿基對只能一個一個地從這個孔內(nèi)過去,通過測定堿基對經(jīng)過納米孔時的電流,來確定堿基對的大小、類型等,完成基因測序。
    陳云飛說,這就像一個人要經(jīng)過一道門,胖子過去時帶動的風大,瘦子過去時帶動的風就小,人們可以通過測量風的大小來判斷這個人的體型。
    據(jù)介紹,這項技術(shù)的難點在于“針眼”材料的選擇,以及堿基對通過“針眼”時電流大小的測定。目前,這兩道坎均已被突破,下一步,他們將繼續(xù)研究縮小“洞”的大小,提高測序精度、縮短測序時間,爭取在一到兩年內(nèi)實現(xiàn)“一滴血一天測出人體全基因序列”的目標,縮短找到治療疾病方法的時間。

(責任編輯:秋彤)

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