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融合基因: 是致癌魔鬼還是治癌天使?

來源:科技日報 時間:2019-05-28 11:13:01 熱度:1242

本報記者 趙漢斌

視覺中國

    基因是遺傳信息的基本單位,它攜帶著構(gòu)建、維護以及修復(fù)生物體的必備信息,同時也支持著生命的基本構(gòu)造和性能,儲存著生命的種族、血型、孕育、生長、凋亡等過程的全部信息,決定生命健康的內(nèi)在因素。因此暢銷書《基因傳》作者、腫瘤專家和知名科普作家悉達多·穆吉克將其稱為“眾生之源”。
    幾天前,《自然·通訊》雜志刊載了一篇關(guān)于融合基因的最新研究。研究人員利用CRISPR基因編輯技術(shù),揭示了能夠?qū)Π┘毎L起到至關(guān)重要作用的融合基因類型,并且發(fā)現(xiàn)了一種新的融合基因,可為包括腦癌和卵巢癌在內(nèi)的多種癌癥提供新的藥物靶點。融合基因,既是導(dǎo)致腫瘤的“魔鬼”,也能成為靶向治療癌癥的天使。
    由染色體易位、缺失等原因?qū)е?br />     作為中科院昆明動物研究所腫瘤生物學(xué)學(xué)科組負責(zé)人,為乳腺癌等腫瘤發(fā)現(xiàn)多個候選靶標的陳策實研究員在接受科技日報記者采訪時表示,人類基因組中約有2萬多個不同的編碼基因,正常情況下,它們會各自有條不紊地執(zhí)行不同的功能。但人們發(fā)現(xiàn),在腫瘤發(fā)生時,往往伴隨著基因組水平的斷裂和重新拼接。當(dāng)兩個或多個基因的編碼區(qū)斷裂,并與別的基因連接,則有可能形成位于同一套調(diào)控序列之下的新基因片段,這就是融合基因。一般由染色體易位、缺失等原因所致,通常情況下,它們會導(dǎo)致序列或者功能異常表達產(chǎn)物即融合蛋白的產(chǎn)生。
    早在2009年,美國密西根大學(xué)綜合性癌癥研究中心推出了當(dāng)時比較新的一種基因檢測技術(shù),當(dāng)將染色體放在一起時基因便能發(fā)生融合。這種融合被認為是導(dǎo)致某些癌癥形成的機制。他們在《自然》雜志上發(fā)表的研究認為,這種基因融合的發(fā)現(xiàn)有可能成為診斷癌癥的標記或者作為今后藥物作用的靶點。研究人員還在前列腺癌細胞中鑒別了數(shù)個融合蛋白,而且,這些融合物只見于癌細胞。
    到目前為止,人們已經(jīng)鎖定了大約2萬個融合基因,但是它們在癌癥發(fā)展中的確切功能和作用,人們?nèi)灾跎佟R虼?,區(qū)分融合基因是否對癌癥存活有影響,具有重要的臨床意義。
    腫瘤產(chǎn)生,或因基因組重排作祟
    在很早以前,科學(xué)家們就觀察到了細胞“動力工廠”線粒體的變化在癌癥生長中的作用。2018年《自然》雜志發(fā)表了哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心的一項重要成果,兩個相鄰基因的融合會導(dǎo)致線粒體過度激活,增加幫助細胞生長的“燃料”數(shù)量,從而導(dǎo)致癌癥。研究人員還發(fā)現(xiàn),靶向這種新發(fā)現(xiàn)癌癥途徑的藥物可以阻止腫瘤生長,并在人類癌細胞和存在腦癌的小鼠中得到了證實。
    陳策實認為,引起基因融合的基因重排類型主要包括平衡和非平衡重排。平衡重排是癌癥中最常見基因融合方式,重排后染色體組的總量沒有增減,只是結(jié)構(gòu)稍有變化;另外非平衡重排指基因重排后染色體組的總量發(fā)生了改變,由基因缺失、重復(fù)等因素造成。
    “引起基因融合的基因組重排,一是可能會導(dǎo)致原有基因過量表達,二是可能導(dǎo)致嵌合基因形成引起具有新功能的蛋白產(chǎn)生,這些異常通常在癌癥發(fā)生的早期階段發(fā)揮重要作用?!标惒邔嵰詫?dǎo)致急性淋巴細胞白血病的BCR-ABL1融合癌基因為例介紹道,22號染色體長臂與9號染色體發(fā)生易位形成新的染色體,致使相關(guān)基因重排,這種重排方式將BCR基因的5’端的部分基因和ABL1基因的3’端的部分序列連接在一起,形成一個新的融合蛋白BCR-ABL1,該蛋白具有很強的酪氨酸激酶活性,具有強促癌功能。基于此,人們開發(fā)出靶向藥物格列衛(wèi),針對的就是該融合蛋白。
    最新研究中,哥倫比亞大學(xué)醫(yī)學(xué)中心及其合作者分析了來自43種不同癌癥類型的1000多種人類癌細胞系中的8000多種融合基因。他們發(fā)現(xiàn),90%的融合基因在癌癥中并不起重要作用,但當(dāng)從病人腫瘤的基因組重排推斷癌癥的原因時,“這些結(jié)果應(yīng)該被考慮”。
    現(xiàn)有檢測方法優(yōu)劣并存
    融合基因通常是將兩個或多個基因的編碼區(qū)首尾相連,構(gòu)成嵌合基因。根據(jù)構(gòu)成,既有對功能基因進行示蹤、研究其功能及特性的功能性融合,也有利用信號肽或單體序列攜帶目的基因高效表達,從而提取純化目的蛋白的融合;還有增強基因功能、擴大基因應(yīng)用范圍的融合等。
    正因為融合基因的發(fā)現(xiàn),有可能成為診斷癌癥的標記或者藥物的靶點,因此融合基因檢測對癌癥臨床診療及預(yù)后都具有實際意義,可以指導(dǎo)臨床醫(yī)生制定科學(xué)的治療方案,避免發(fā)生治療不足或過度。
    陳策實介紹,基因融合檢測的金標準是熒光原位雜交(FISH),這種方法可以檢測目標基因在染色體中的定位,從而判斷是否有基因異位的發(fā)生,但實驗操作復(fù)雜、技術(shù)要求較高;其次,免疫組化(IHC)也是常用的檢測方法之一,是利用特異性抗體檢測目的蛋白表達水平的方法,能夠顯示靶標蛋白是否表達,以及表達量是否有改變,缺點是通常無法直接檢測融合基因,對結(jié)果的判讀主觀性較強;第三個方法是反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR),優(yōu)點是可操作性強,設(shè)計出針對已知融合基因的PCR引物,能簡便快速地進行檢測和判斷。這三種技術(shù)只適用于腫瘤組織樣本,限制了應(yīng)用的拓展,因為很多晚期癌癥患者無法進行手術(shù)取樣,因此無法使用這些檢測技術(shù)檢測融合基因的狀態(tài)。
    但高通量測序(NGS)和微滴式數(shù)字PCR技術(shù)(ddPCR)不同,它不僅可以檢測組織樣本中的融合基因,還適用于非創(chuàng)傷手段獲取的樣本如血漿等樣本,進行腫瘤融合基因的檢測;NGS還可以一次檢測多種基因、多種融合變體,發(fā)現(xiàn)未知變異,但實驗操作和數(shù)據(jù)分析都很耗時,對樣本的要求較高;ddPCR是對檢測樣本采用微滴化處理后進行PCR擴增,從而對少量樣本進行多個基因位點的檢測,缺點是無法對未知的融合基因進行檢測。
    陳策實認為,這些融合基因的檢測方式各有優(yōu)劣,往往需要結(jié)合多種檢測方式,進行綜合判斷。

(責(zé)任編輯:秋彤)

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